More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2838 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  36.82 
 
 		 1421 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  36.24 
 
 		 1446 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  37.48 
 
 		 1604 aa  801    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1654 aa  3337    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  36.58 
 
 		 1583 aa  805    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1531 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.76 
 
 		 1568 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  31.55 
 
 		 1530 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1410 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1586 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1409 aa  539  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1400 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  31.74 
 
 		 1385 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1411 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1229 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.45 
 
 		 1362 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  31.35 
 
 		 1386 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  31.01 
 
 		 1348 aa  480  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  30.76 
 
 		 1140 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1419 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1554 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  33.46 
 
 		 924 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1547 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1520 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1390 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1402 aa  420  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1527 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1550 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1551 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.88 
 
 		 1626 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.01 
 
 		 1560 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.5 
 
 		 1359 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1602 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.46 
 
 		 1609 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.58 
 
 		 1620 aa  380  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  31.24 
 
 		 866 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1525 aa  355  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  30.74 
 
 		 855 aa  346  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1509 aa  346  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1528 aa  344  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.13 
 
 		 1379 aa  334  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 867 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.7 
 
 		 1429 aa  327  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.98 
 
 		 1981 aa  318  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1319 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.27 
 
 		 1573 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1611 aa  307  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1317 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  33.59 
 
 		 553 aa  283  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.66 
 
 		 1572 aa  271  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.06 
 
 		 1576 aa  266  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  31.21 
 
 		 555 aa  265  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  26.6 
 
 		 1388 aa  263  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  25.21 
 
 		 1150 aa  259  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.69 
 
 		 1586 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  23.89 
 
 		 1150 aa  256  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  24.7 
 
 		 1150 aa  254  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1149 aa  253  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1150 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.65 
 
 		 1595 aa  252  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1197 aa  245  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.5 
 
 		 1415 aa  241  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.73 
 
 		 1593 aa  240  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.38 
 
 		 1614 aa  239  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 598 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1251 aa  233  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  32.38 
 
 		 497 aa  233  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  25.57 
 
 		 1410 aa  232  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1490 aa  230  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  24.98 
 
 		 1397 aa  229  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1405 aa  229  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  24.78 
 
 		 1365 aa  225  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.94 
 
 		 1428 aa  224  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.05 
 
 		 1397 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1397 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  25.18 
 
 		 1417 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.86 
 
 		 1434 aa  221  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1411 aa  221  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  25.9 
 
 		 1397 aa  221  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  26.11 
 
 		 1308 aa  221  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  24.9 
 
 		 1411 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  25.97 
 
 		 1411 aa  219  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1553 aa  219  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  26.06 
 
 		 1411 aa  218  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1411 aa  218  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  26.89 
 
 		 1411 aa  217  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  24.69 
 
 		 1394 aa  217  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1189 aa  217  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.92 
 
 		 1543 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  24.67 
 
 		 1399 aa  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  26.49 
 
 		 1377 aa  216  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1527 aa  214  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1409 aa  214  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1149 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1377 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.83 
 
 		 1539 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  32.03 
 
 		 583 aa  214  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  25.6 
 
 		 1388 aa  213  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1565 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>