More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2825 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  570  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  79.23 
 
 
312 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.87 
 
 
312 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  73.33 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  62.84 
 
 
298 aa  348  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  60.2 
 
 
335 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  61.99 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.6 
 
 
324 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  56.14 
 
 
302 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.45 
 
 
310 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.45 
 
 
310 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  52.26 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  48.75 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  48.8 
 
 
324 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  52 
 
 
295 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.42 
 
 
308 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  48.41 
 
 
322 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  47.39 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  47.39 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  47.39 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  42.07 
 
 
294 aa  211  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  47.39 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  47.39 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  47 
 
 
308 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  40 
 
 
300 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  47.16 
 
 
308 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  44.33 
 
 
310 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  44.1 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  44.64 
 
 
310 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  44.33 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  44.33 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  43.97 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  43.97 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  43.97 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  46.07 
 
 
295 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.16 
 
 
303 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.64 
 
 
299 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  43.66 
 
 
303 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  42.75 
 
 
311 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  36.4 
 
 
298 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  38.71 
 
 
295 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  32.78 
 
 
312 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  41.5 
 
 
319 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  37.68 
 
 
297 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  39.93 
 
 
310 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  39.26 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  40.59 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  44.4 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.48 
 
 
283 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  35.53 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  41.67 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  37.8 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  40.23 
 
 
291 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  39.77 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  39.85 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  38.81 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  34.77 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.59 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  38.04 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  38.29 
 
 
290 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  42.59 
 
 
319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.15 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.12 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  36.73 
 
 
305 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  38.58 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  38.87 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  37.36 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  39.1 
 
 
321 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  39.1 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
300 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  34.63 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  35.36 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  32.61 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  32.97 
 
 
292 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.01 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  33.68 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  33.72 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  35.82 
 
 
379 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
324 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
313 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
326 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  32.62 
 
 
310 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  35.19 
 
 
304 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
324 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
307 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 
301 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  33.57 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  32.96 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  44.64 
 
 
119 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  31.13 
 
 
364 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  23.94 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  32.56 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.59525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>