200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2800 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  333  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  60.67 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  60.67 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  61.49 
 
 
174 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  53.11 
 
 
179 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  42.63 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.81 
 
 
842 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  45.64 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.75 
 
 
823 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  39.18 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  53.54 
 
 
525 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  53 
 
 
525 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  54.08 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  63.24 
 
 
532 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  61.76 
 
 
532 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  61.76 
 
 
532 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  56.19 
 
 
214 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  60.29 
 
 
532 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  60.29 
 
 
535 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  60.29 
 
 
531 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  60.29 
 
 
535 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
557 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  58.82 
 
 
538 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  57.35 
 
 
544 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 
321 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 
261 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.24 
 
 
560 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  37.6 
 
 
310 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 
364 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  41.05 
 
 
271 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  38.24 
 
 
271 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 
263 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 
262 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 
263 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  40.2 
 
 
464 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 
218 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25.81 
 
 
537 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
316 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  30.51 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 
270 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 
543 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.26 
 
 
542 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  35.25 
 
 
648 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  26.23 
 
 
260 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
243 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  26.23 
 
 
260 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 
296 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
248 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 
445 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.5 
 
 
270 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
270 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 
270 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 
544 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
306 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  31 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  30.14 
 
 
440 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
270 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  35.24 
 
 
280 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
525 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.13 
 
 
510 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  48 
 
 
371 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  48 
 
 
369 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  48 
 
 
369 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
440 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  48 
 
 
358 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0354  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 
315 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  29.7 
 
 
239 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 
514 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
230 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  48 
 
 
358 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.1 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 
373 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
319 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  31.48 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 
555 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 
587 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  38.89 
 
 
463 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 
228 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35 
 
 
261 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  28.32 
 
 
240 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 
225 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  27.15 
 
 
317 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
831 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 
196 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>