53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2789 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  35.23 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  32.95 
 
 		 271 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  33.46 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  33.07 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  30.31 
 
 		 282 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  26.77 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.41 
 
 		 369 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 366 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  26.82 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.35 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.85 
 
 		 375 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 364 aa  45.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  28.29 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.39 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  23.89 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 381 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.71 
 
 		 377 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  22.88 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 		 348 aa  42  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  27.62 
 
 		 376 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 378 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 376 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>