More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2727 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  55.37 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  47.14 
 
 		 234 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  53.45 
 
 		 155 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 263 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  53.57 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 438 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 		 368 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  48.03 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 280 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  51.22 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  53.72 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 318 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  44.09 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  49.12 
 
 		 291 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  43.2 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  47.01 
 
 		 285 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  46.67 
 
 		 278 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 296 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  49.53 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  43.9 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.44 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  48.74 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 261 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  46.03 
 
 		 271 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  46.96 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 256 aa  98.6  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  47.15 
 
 		 218 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  41.84 
 
 		 272 aa  98.2  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 235 aa  97.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  48.36 
 
 		 327 aa  97.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 		 283 aa  97.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 292 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 		 260 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  50.39 
 
 		 281 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  49.21 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.64 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  49.15 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 280 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.02 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 		 362 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 442 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  36.22 
 
 		 259 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  36.22 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.57 
 
 		 146 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  36.8 
 
 		 261 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  43.97 
 
 		 362 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 290 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  44.54 
 
 		 326 aa  95.5  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  35.43 
 
 		 261 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 261 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  35.43 
 
 		 261 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  35.43 
 
 		 261 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.27 
 
 		 249 aa  95.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 238 aa  94.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 242 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  40.3 
 
 		 329 aa  95.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  36.22 
 
 		 261 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 		 299 aa  94.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 239 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 239 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  41.54 
 
 		 245 aa  94.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 239 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  43.61 
 
 		 295 aa  94.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.51 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  36.22 
 
 		 261 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  44.09 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.55 
 
 		 649 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.67 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 649 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  46.77 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  43.41 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  43.41 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.79 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 		 333 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>