99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2675 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
834 aa  1695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  29.08 
 
 
757 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  28.93 
 
 
739 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  27.07 
 
 
767 aa  119  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.84 
 
 
739 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 
718 aa  114  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.56 
 
 
1322 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  35.18 
 
 
1029 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  41.67 
 
 
861 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  41.24 
 
 
487 aa  107  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  46.73 
 
 
1426 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 
1332 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3946  hypothetical protein  31.83 
 
 
555 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  44.74 
 
 
1427 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  44.74 
 
 
1422 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  33.99 
 
 
944 aa  98.2  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  27.86 
 
 
786 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  36.57 
 
 
954 aa  93.2  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  26.74 
 
 
741 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  26.74 
 
 
741 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  35 
 
 
718 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  28.92 
 
 
1066 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  34.68 
 
 
1011 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  26.63 
 
 
741 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  26.46 
 
 
675 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  28.33 
 
 
885 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  30.1 
 
 
870 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07279  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01300)  24.41 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  40.24 
 
 
475 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  29.29 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  29.65 
 
 
566 aa  75.1  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  32.56 
 
 
770 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  33.85 
 
 
206 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  48.62 
 
 
1199 aa  71.6  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
669 aa  70.5  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  28.87 
 
 
948 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  37.86 
 
 
717 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  35.09 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  30.16 
 
 
826 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  44.68 
 
 
782 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  27.87 
 
 
710 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 
1050 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
659 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  29.15 
 
 
509 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  34.71 
 
 
1172 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  26.67 
 
 
690 aa  64.3  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  36.24 
 
 
548 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  42.27 
 
 
1847 aa  63.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.51 
 
 
728 aa  62.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  26.62 
 
 
701 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.05 
 
 
736 aa  61.6  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.8 
 
 
3027 aa  61.2  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.41 
 
 
12684 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.72 
 
 
512 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0121  hypothetical protein  35.85 
 
 
362 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  28.24 
 
 
518 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.7 
 
 
1067 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1754  hypothetical protein  25.93 
 
 
386 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  29.82 
 
 
540 aa  58.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  29.33 
 
 
504 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3960  hypothetical protein  25.93 
 
 
405 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698754  normal  0.0204382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  41.94 
 
 
918 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.95 
 
 
1401 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0013  F5/8 type C domain protein  31.25 
 
 
663 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.538854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.46 
 
 
2334 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  36.46 
 
 
1401 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1085  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.97 
 
 
669 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.05 
 
 
1073 aa  51.6  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
671 aa  50.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.08 
 
 
6678 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 
277 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  36.75 
 
 
879 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0120  hypothetical protein  31.82 
 
 
472 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  30 
 
 
675 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  25.53 
 
 
215 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.19 
 
 
795 aa  49.7  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1086  coagulation factor 5/8 type domain protein  27 
 
 
665 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  30.77 
 
 
1164 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03486  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 
361 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  31.73 
 
 
523 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  40 
 
 
1115 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  42.11 
 
 
3544 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  25.73 
 
 
652 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  28.99 
 
 
1406 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0414  hypothetical protein  37.35 
 
 
884 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  43.82 
 
 
648 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 
658 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.71 
 
 
2503 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  42.86 
 
 
656 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.01 
 
 
1295 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  31.63 
 
 
1053 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  32.53 
 
 
869 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  36.7 
 
 
1628 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  23.98 
 
 
543 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  43.48 
 
 
692 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  32.53 
 
 
1114 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  38.46 
 
 
1247 aa  44.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  37.08 
 
 
278 aa  44.3  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  34 
 
 
972 aa  44.3  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>