12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2569 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2569    100 
 
 		 315 bp  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123761  decreased coverage  0.00182667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  87.14 
 
 		 582 bp  67.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  85.71 
 
 		 582 bp  60  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  85.71 
 
 		 582 bp  60  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  85.29 
 
 		 582 bp  56  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  85.29 
 
 		 582 bp  56  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  85.29 
 
 		 582 bp  56  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  96.43 
 
 		 2124 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  96.43 
 
 		 2142 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  96.43 
 
 		 2124 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  96.43 
 
 		 2124 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  96.43 
 
 		 2160 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>