More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2450 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 356 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  74.78 
 
 		 358 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  74.78 
 
 		 345 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  70.29 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  60 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  52.46 
 
 		 342 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  52.02 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  51.57 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  52.16 
 
 		 344 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  51.57 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  51.28 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  51 
 
 		 347 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  52.16 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  51 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  50.72 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  47.54 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  45.38 
 
 		 343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  49.86 
 
 		 345 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  47.83 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  49.28 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  50 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  48.13 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  49.57 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  48.43 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  49.57 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  47.84 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  44.06 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  44.96 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  45.09 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  45.24 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  42.07 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  45.93 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  42.65 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.29 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  40.92 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  42.45 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 342 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  45.93 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  42.37 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  37.79 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.77 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  41.98 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  39.58 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.62 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.11 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  40.82 
 
 		 340 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  40.12 
 
 		 582 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  37.99 
 
 		 577 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  41.89 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  37.65 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  40.99 
 
 		 578 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  40.41 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.41 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.83 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  39.83 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.83 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.83 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  39.83 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  41.56 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  38.95 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  39.37 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  39.37 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  39.66 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  34.03 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  39.37 
 
 		 340 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  39.37 
 
 		 340 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  39.47 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  39.18 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  38.19 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  36.81 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  44.58 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  43.36 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  42.54 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  36.89 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  42.24 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  35.99 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  32.16 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  32.01 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  37.86 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  37.28 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  37.22 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  37.07 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.4 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  38.81 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  36.68 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38.17 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  36.61 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.85 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  31.89 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  34.62 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.02 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  30.98 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  36.03 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>