29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2353 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  62.16 
 
 		 539 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  100 
 
 		 527 aa  1099    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  38.28 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  38.59 
 
 		 523 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  44.62 
 
 		 568 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  35.26 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  35.6 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  47.57 
 
 		 194 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  45.86 
 
 		 229 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1463  Phage terminase, large subunit, PBSX  29.88 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.8452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  34.47 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  27.11 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  29.73 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2427  terminase large subunit  41 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5696  PBSX family phage terminase large subunit  30.46 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  28.51 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  26.59 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  27.17 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  28.78 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  26.6 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  25.18 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  27.3 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  25.95 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  27.92 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0227  PBSX family phage terminase large subunit  26.02 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5804  putative phage terminase large subunit  33.58 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1143  phage terminase, large subunit, PBSX family  26.48 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1942  PBSX family phage terminase large subunit  26.13 
 
 		 433 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16151  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3056  phage terminase, large subunit, PBSX family  27.75 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>