172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2325 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  828    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  34.62 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  35.19 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  35.01 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  34.36 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  34.78 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  29.57 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  28.75 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  30.77 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  28.23 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  27.52 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.17 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  32.38 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.59 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.6 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.56 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.35 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.32 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.32 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.92 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.43 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.1 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.23 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.94 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  24.82 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.7 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  41.21 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  27.38 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  26.55 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  27.05 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.11 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.59 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  30.4 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  24.69 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  31.52 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  29.61 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  35.84 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  27.4 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2937  integrase, putative  36.28 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.456202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  27.08 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.72 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  26.55 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.21 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  26.04 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  28.93 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  23.62 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.11 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  20.7 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  26.51 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  23.89 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  22.16 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  21.34 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.4 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  20.24 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.26 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  27.23 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  26.07 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.75 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.06 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15950  site-specific recombinase XerD  26.26 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.182079  hitchhiker  0.000000384619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.25 
 
 		 292 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  29.69 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.17 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.15 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.04 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2258  tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  26.86 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.37 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.32 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 310 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  27.66 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  27.78 
 
 		 315 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  20.54 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  24.44 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  25.96 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  22.31 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  19.49 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>