More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2274 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 411 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  67.65 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  49.6 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  49.6 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  49.6 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  49.34 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  49.6 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  49.21 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  49.21 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  49.07 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  48.94 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  48.94 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3576  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.0569566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  51.13 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 385 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  49.37 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  50.71 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.42 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.42 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.42 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.42 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.42 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.42 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  40 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.41 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  37 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  39.14 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  35.62 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  37.74 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  35.66 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  35.66 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1933  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  39.52 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>