112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2264 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  786    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  54.78 
 
 
397 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  47.81 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  45.15 
 
 
389 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.18 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  24.11 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.95 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.11 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.95 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.12 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  24.74 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.01 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.73 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.34 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  35.79 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.81 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.17 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.6 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  25.25 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  43.94 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22.86 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.01 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.79 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  38.38 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.68 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  23.99 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.86 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.77 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  44.78 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  29.37 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  31.82 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  20.11 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  36.36 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  25.28 
 
 
376 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  37.31 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  23.32 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.9 
 
 
367 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  46.67 
 
 
422 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.9 
 
 
367 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  36.92 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  30.91 
 
 
454 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  23.81 
 
 
419 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  32.84 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  26.43 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  26.43 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.12 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  37.31 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  30.39 
 
 
132 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  44.68 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  38.46 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  38.46 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  38.46 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  38.46 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  38.46 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  30.69 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  48.94 
 
 
574 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.64 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
394 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  26.45 
 
 
416 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  37.25 
 
 
359 aa  47  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.28 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  40 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  39.22 
 
 
613 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  32.84 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  20.75 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  27.78 
 
 
626 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  40 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.19 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.75 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  31.11 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  20.75 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  21.39 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  40 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  36.92 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  36.51 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  26.16 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  29.2 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  28.71 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.37 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.44 
 
 
647 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  29.41 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  41.3 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  29.41 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  23.56 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  29.31 
 
 
506 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  39.13 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  36.92 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0105  SMC domain protein  48.98 
 
 
543 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  36.76 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.04 
 
 
626 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  39.13 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  39.13 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>