More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2263 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  82.28 
 
 		 564 aa  926    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  60.66 
 
 		 550 aa  663    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  85.69 
 
 		 565 aa  960    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  60.88 
 
 		 555 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  60.65 
 
 		 559 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  80 
 
 		 558 aa  926    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  61.79 
 
 		 552 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  60.11 
 
 		 559 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  61.36 
 
 		 549 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  72.94 
 
 		 558 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  81.37 
 
 		 557 aa  916    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  61.36 
 
 		 548 aa  683    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  72.34 
 
 		 559 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  65.16 
 
 		 556 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 572 aa  1149    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  85.69 
 
 		 565 aa  961    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  60.62 
 
 		 566 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  58.96 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  56.5 
 
 		 561 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  58.78 
 
 		 567 aa  611  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  59.5 
 
 		 561 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  55.69 
 
 		 564 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  57.64 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  57.64 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  57.48 
 
 		 567 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  56.35 
 
 		 567 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  57.45 
 
 		 567 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  57.27 
 
 		 567 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  55.81 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  57.17 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  54.01 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  53.83 
 
 		 575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  54.7 
 
 		 582 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  54.8 
 
 		 559 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  54.19 
 
 		 575 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  55.68 
 
 		 552 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  55.58 
 
 		 552 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.56 
 
 		 572 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  54.5 
 
 		 581 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  54.1 
 
 		 574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  53.15 
 
 		 556 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  52.53 
 
 		 570 aa  561  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  53.37 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.51 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.07 
 
 		 568 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  53.96 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  52.74 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  52.15 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  49.82 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  50.72 
 
 		 576 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 580 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  49.29 
 
 		 572 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.28 
 
 		 567 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.36 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  45.77 
 
 		 538 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.83 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.26 
 
 		 551 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  41.7 
 
 		 583 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  39.51 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  40.88 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.38 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.08 
 
 		 543 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.89 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  36.58 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  36.53 
 
 		 587 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.11 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.29 
 
 		 555 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.51 
 
 		 583 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.65 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.45 
 
 		 583 aa  250  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.65 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  29.46 
 
 		 545 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.38 
 
 		 573 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  29.24 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.2 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  29.55 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.47 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.68 
 
 		 556 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.61 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.41 
 
 		 578 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.02 
 
 		 563 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 		 572 aa  247  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.67 
 
 		 563 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.02 
 
 		 573 aa  246  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  30.71 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.1 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  29.61 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.72 
 
 		 574 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.06 
 
 		 573 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  30.6 
 
 		 547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>