86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2246 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2246  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  100 
 
 
350 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279182  hitchhiker  0.00000435705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2177  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  56.63 
 
 
334 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1987  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  56.59 
 
 
334 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.021694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4125  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  53.99 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505866  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0949  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.72 
 
 
351 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3414  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.46 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302272  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0543  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  52.51 
 
 
354 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.63 
 
 
341 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0135  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.63 
 
 
341 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3700  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  51.98 
 
 
341 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0519  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.45 
 
 
341 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0543  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.45 
 
 
341 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436571  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2767  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  53.03 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1176  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  53.1 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0586  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  51.93 
 
 
341 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0942826  normal  0.0399726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  52.68 
 
 
346 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3488  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1269  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0409  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3296  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3451  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.37 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  52.37 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51340  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  49.71 
 
 
322 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03672  hypothetical protein  46.11 
 
 
334 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03723  putative conserved protein  46.11 
 
 
334 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4213  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  46.11 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6942  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  46.71 
 
 
380 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967621  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0392  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  43.41 
 
 
328 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4620  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  50.38 
 
 
295 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4804  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  48.47 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0138053  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6031  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  41.74 
 
 
303 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0444196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3690  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  40.38 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0962  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  40.13 
 
 
296 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0937  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  40.13 
 
 
296 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2598  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  40.33 
 
 
296 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2012  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.91 
 
 
319 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975056  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3534  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  40 
 
 
295 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00123  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  39.93 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1287  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  39.64 
 
 
316 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0108847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2068  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  37.8 
 
 
309 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.195031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0898  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.42 
 
 
353 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3665  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.97 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000857364  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0042  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.76 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.351596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2872  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  38.81 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0437  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  38.75 
 
 
306 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2605  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.45 
 
 
302 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0023  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.22 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3489  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.45 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0743  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  37.05 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.47 
 
 
292 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03577  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  36.47 
 
 
292 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03521  hypothetical protein  36.47 
 
 
292 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.225897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.47 
 
 
292 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4203  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.47 
 
 
292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1097  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.09 
 
 
292 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3906  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.47 
 
 
292 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0502  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  39.39 
 
 
304 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0939  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.05 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.340074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0007  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.33 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0881  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.05 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4059  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.34 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4114  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.67 
 
 
292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3594  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.22 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.943632  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4163  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.35 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2748  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  36.18 
 
 
300 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0845  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  36.98 
 
 
305 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4221  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.02 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0545  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  37.5 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1422  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0038  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  36.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4929  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.64 
 
 
304 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876987  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3614  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  35.55 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0028  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  34.91 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1242  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  37.97 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.502361  normal  0.183094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1371  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  35.74 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3530  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.35 
 
 
318 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0054  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.63 
 
 
292 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3914  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  36.36 
 
 
284 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0112503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3954  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.84 
 
 
334 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3833  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  33.77 
 
 
303 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1015  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.84 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174536  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2588  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  31.82 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2759  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  31.44 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2998  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  28.88 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296432  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3778  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  29.76 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.585219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>