More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2238 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  35.94 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.11 
 
 		 392 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 248 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 234 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 		 225 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  39.83 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 231 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 224 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 236 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 236 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  43.59 
 
 		 705 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 238 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  42.86 
 
 		 250 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 227 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  42.28 
 
 		 1366 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  36.36 
 
 		 1347 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  42.86 
 
 		 250 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.31 
 
 		 236 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  42.86 
 
 		 250 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 232 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  45 
 
 		 705 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  40.77 
 
 		 241 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 237 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.4 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 228 aa  94  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  42.06 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  38.98 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  46.23 
 
 		 238 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0173  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 232 aa  93.6  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  43.97 
 
 		 454 aa  93.6  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 236 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 239 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  46.23 
 
 		 238 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 239 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 239 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  45.83 
 
 		 247 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 253 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 253 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.97 
 
 		 457 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 243 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  38.46 
 
 		 1374 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 231 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 240 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1559 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  45.28 
 
 		 238 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.03 
 
 		 378 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 273 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 406 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 406 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 255 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  40.91 
 
 		 269 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 236 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 234 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 234 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>