More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1975 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  84.36 
 
 
323 aa  554  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  84.66 
 
 
323 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  83.17 
 
 
304 aa  517  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  83.39 
 
 
312 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  76.95 
 
 
325 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  75 
 
 
320 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  70.55 
 
 
323 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  51.5 
 
 
335 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  51.07 
 
 
331 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.72 
 
 
336 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.67 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  46.46 
 
 
322 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.1 
 
 
325 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.98 
 
 
333 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.67 
 
 
345 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.67 
 
 
345 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.16 
 
 
323 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  47.8 
 
 
309 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.08 
 
 
339 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  44.62 
 
 
331 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.67 
 
 
360 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.28 
 
 
355 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.77 
 
 
339 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.46 
 
 
327 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.12 
 
 
349 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
331 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.78 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.85 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.79 
 
 
344 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  43.67 
 
 
330 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.63 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  46.8 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 
314 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.39 
 
 
328 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  46.46 
 
 
328 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.73 
 
 
334 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.55 
 
 
327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.12 
 
 
323 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.55 
 
 
328 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.1 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.1 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.25 
 
 
328 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.24 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.62 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.67 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.16 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.75 
 
 
330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.11 
 
 
328 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.09 
 
 
325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.53 
 
 
324 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.73 
 
 
334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.94 
 
 
358 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  45.31 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.1 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.81 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.07 
 
 
325 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.67 
 
 
328 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.9 
 
 
327 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  42.67 
 
 
326 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.85 
 
 
333 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  43.33 
 
 
332 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  41.52 
 
 
324 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.67 
 
 
331 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.01 
 
 
322 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.26 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42 
 
 
317 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.77 
 
 
338 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.07 
 
 
335 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.51 
 
 
320 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.75 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.48 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.67 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.17 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.11 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  41.41 
 
 
333 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.45 
 
 
331 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.45 
 
 
331 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43.77 
 
 
339 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.56 
 
 
330 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  41.52 
 
 
339 aa  233  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  40.61 
 
 
327 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.33 
 
 
339 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.77 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  45.33 
 
 
318 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.01 
 
 
318 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 
335 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.39 
 
 
332 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.64 
 
 
320 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.49 
 
 
331 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.4 
 
 
356 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.4 
 
 
335 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  39.26 
 
 
337 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>