More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1945 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1945  argininosuccinate lyase  100 
 
 
533 aa  1077    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000741836  normal  0.0116194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1775  argininosuccinate lyase  74.57 
 
 
509 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4655  argininosuccinate lyase  73.89 
 
 
508 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49320  L-aspartate-like protein  43.07 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222924  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0630  fumarate lyase  42.92 
 
 
496 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  0.423973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  27.9 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  29.02 
 
 
500 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  26.77 
 
 
502 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
502 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  26.77 
 
 
502 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  27.41 
 
 
509 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  28.97 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  27.93 
 
 
502 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  27.93 
 
 
502 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  26.47 
 
 
487 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  26.57 
 
 
502 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 
502 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  26.07 
 
 
502 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  29.57 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  25.85 
 
 
502 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  25.55 
 
 
491 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  29.9 
 
 
492 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  28.75 
 
 
459 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  29.52 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  29.46 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  29.82 
 
 
458 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 
463 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  26.04 
 
 
462 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  26.04 
 
 
462 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  29.09 
 
 
469 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  28.01 
 
 
499 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  26.28 
 
 
462 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  26.04 
 
 
462 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  28.75 
 
 
481 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  26.04 
 
 
462 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  26.44 
 
 
463 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  27.51 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  26.09 
 
 
462 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  25.12 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  24.94 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  27.32 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.9 
 
 
624 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  27.92 
 
 
460 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  25.81 
 
 
462 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  28.61 
 
 
474 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  25.49 
 
 
481 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.35 
 
 
624 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  27.98 
 
 
463 aa  139  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  26.54 
 
 
510 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  29.85 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  29.77 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.75 
 
 
624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  27.41 
 
 
462 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  27.13 
 
 
464 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  25.63 
 
 
481 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  32.73 
 
 
459 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  25.85 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 
492 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  28.24 
 
 
488 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  29.59 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  27.2 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  27.46 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  26.2 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  29.43 
 
 
456 aa  134  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3564  argininosuccinate lyase  29.77 
 
 
323 aa  133  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  27.94 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  28.32 
 
 
493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  27.13 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  26.72 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  29.34 
 
 
457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  30.05 
 
 
457 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  26.76 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  27.07 
 
 
496 aa  131  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  29.75 
 
 
520 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  26.63 
 
 
458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  28.97 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0488  argininosuccinate lyase  25.71 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.196592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  26.6 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  26.03 
 
 
499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  28.21 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  27.59 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  30.98 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  28.97 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  30.5 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  29.46 
 
 
458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  28.75 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  30.09 
 
 
463 aa  128  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>