78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1944 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  69.21 
 
 		 298 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  68.49 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  64.48 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  73.63 
 
 		 276 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  73.63 
 
 		 276 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  67 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  65.87 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  48.76 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  45.05 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  36.24 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  33.69 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  36.13 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  36.57 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  39.22 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  37.37 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  36.61 
 
 		 268 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  36.61 
 
 		 268 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  36.58 
 
 		 268 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  40 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  32.39 
 
 		 251 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  36.81 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  33.73 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  36.01 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  32.93 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  27.71 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  33.09 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42.71 
 
 		 115 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  25.12 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  26.34 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  24.83 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  28.38 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  28.14 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  29.82 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  24 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  24.68 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.61 
 
 		 277 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  23.94 
 
 		 259 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.49 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  30.07 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.88 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  48.28 
 
 		 104 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.88 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  25.76 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.91 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  27.33 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  25.91 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  23.22 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  24.12 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.19 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  23.35 
 
 		 291 aa  49.3  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.1 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  25.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  24.03 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  25.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  25.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  25.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  25.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  24.81 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  22.83 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.45 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  27.05 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  24.64 
 
 		 246 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.21 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.81 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  47.46 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  23.39 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  47.46 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.2 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  22.93 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  21.21 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  21.6 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  21.12 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23.7 
 
 		 255 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.45 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.23 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  25.96 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>