78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1858 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  100 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  62.14 
 
 
226 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  62.14 
 
 
226 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  60.18 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  49.07 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  53.57 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  45.1 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1086  17 kDa surface antigen  51.83 
 
 
238 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  34.48 
 
 
175 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  40.72 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  38.52 
 
 
178 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  40 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  39.55 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  39.26 
 
 
179 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  37.31 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  36.55 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  37.91 
 
 
179 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  36.13 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  37.04 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  34.59 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  34.59 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  33.82 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  36.57 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  37.31 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  32.2 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  33.83 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  33.82 
 
 
179 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  38.35 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  34.19 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  34.19 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  37.74 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  34.19 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  33.55 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  59.26 
 
 
165 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  32.24 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  59.26 
 
 
165 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  32.69 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  39.67 
 
 
263 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  27.49 
 
 
257 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  27.91 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  35.9 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  50.75 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  37.75 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  49.12 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  49.12 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  54.9 
 
 
272 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  34.62 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  58.54 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  55.56 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  55.56 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  56.1 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  55.56 
 
 
216 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  56.1 
 
 
204 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  55.56 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  51.22 
 
 
146 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  68.97 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  30 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3764  hypothetical protein  66.67 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  28.74 
 
 
181 aa  41.6  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>