69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1806 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  591  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  58.21 
 
 
289 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  50.52 
 
 
304 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  48.58 
 
 
288 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  46.53 
 
 
288 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  47.74 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  43.71 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 
291 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 
298 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 
317 aa  241  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  49.06 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 
295 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  44.81 
 
 
317 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  44.74 
 
 
295 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  44.36 
 
 
295 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
294 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  46.95 
 
 
293 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  44.22 
 
 
293 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  47.04 
 
 
295 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  46.67 
 
 
295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  45.64 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  48.15 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  49.24 
 
 
291 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
404 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 
293 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
395 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
404 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
404 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
404 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  46.62 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  46.04 
 
 
444 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  43.38 
 
 
291 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.29 
 
 
296 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  43.97 
 
 
287 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
299 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
299 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  38.65 
 
 
299 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.64 
 
 
299 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 
307 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 
283 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 
307 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
307 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  34.72 
 
 
292 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  39.11 
 
 
292 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  36.58 
 
 
266 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  31.68 
 
 
293 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
273 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  30.53 
 
 
273 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.76 
 
 
302 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.18 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.47 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
526 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  21.05 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.98 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 
337 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.09 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>