12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1717 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1717  Arc domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000298141  unclonable  0.0000000100109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2124  Arc domain-containing protein  62.5 
 
 		 109 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7066  Arc domain protein DNA binding domain protein  52.27 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000570212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3774  Arc domain-containing protein  56.41 
 
 		 99 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331674  unclonable  0.0000139531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1200  Arc domain-containing protein  46.81 
 
 		 103 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3402  Arc domain-containing protein  52.27 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000582417  unclonable  1.23131e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0652  Mnt  52.78 
 
 		 83 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.778428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3252  Arc domain-containing protein  47.17 
 
 		 71 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000479453  hitchhiker  0.0000000000000551778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51750  hypothetical protein  43.18 
 
 		 107 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2281  Arc domain-containing protein  55.56 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.195095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  41.18 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0670  Arc domain-containing protein  47.62 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.17642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>