130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1617 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
426 aa  879    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  63.85 
 
 
423 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  37.63 
 
 
444 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  35.14 
 
 
420 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  35.28 
 
 
440 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  35.99 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  35.99 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  33.24 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  32.84 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.16 
 
 
413 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  31.89 
 
 
413 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.89 
 
 
413 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  29.82 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  33.85 
 
 
473 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  31.32 
 
 
384 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  34.79 
 
 
409 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  33.24 
 
 
412 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  32 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  29.82 
 
 
524 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  30.79 
 
 
408 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  30.13 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  29.95 
 
 
415 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  30.99 
 
 
434 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  30 
 
 
420 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  30.49 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  29.52 
 
 
424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  27.68 
 
 
404 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29.74 
 
 
417 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  30.99 
 
 
434 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  32.27 
 
 
431 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  32.27 
 
 
444 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  30.29 
 
 
412 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  29.79 
 
 
428 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  28.84 
 
 
404 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  31.02 
 
 
407 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  26.74 
 
 
389 aa  152  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  27.49 
 
 
436 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  25.29 
 
 
390 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  29.79 
 
 
408 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  28.07 
 
 
425 aa  150  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  28.07 
 
 
425 aa  150  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  28.07 
 
 
425 aa  150  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  26.63 
 
 
416 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.92 
 
 
544 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  28.33 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  31.86 
 
 
401 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  27.99 
 
 
397 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  25.79 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  25 
 
 
407 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  28.49 
 
 
392 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  30.34 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  30.29 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  26.51 
 
 
406 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  29.19 
 
 
428 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  28.61 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  32.84 
 
 
460 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  28.89 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  30.95 
 
 
429 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  26.68 
 
 
398 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  28.07 
 
 
432 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2238  phage portal protein, HK97 family  26.37 
 
 
389 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0330088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  27.84 
 
 
542 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.53 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  28.85 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  27.47 
 
 
434 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  25.62 
 
 
399 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  24.06 
 
 
393 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.62 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  26.36 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  24.73 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  24.73 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  27.72 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  29.91 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  29.91 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  25.7 
 
 
429 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  27.38 
 
 
420 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  26.22 
 
 
457 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  28.49 
 
 
414 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  29.02 
 
 
445 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  29.02 
 
 
445 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  28.26 
 
 
833 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  28.26 
 
 
859 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  28.26 
 
 
833 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  27.87 
 
 
451 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  25.47 
 
 
455 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.76 
 
 
455 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25.96 
 
 
436 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25.96 
 
 
436 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  24.02 
 
 
413 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  25.15 
 
 
412 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  25.15 
 
 
412 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.36 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  25.63 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1968  hypothetical protein  26.46 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  29.27 
 
 
225 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  22.61 
 
 
408 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  23.11 
 
 
464 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4384  phage portal protein, HK97 family  25.89 
 
 
264 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0697  HK97 family phage portal protein  24.7 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.25481e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>