67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1607 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  46.48 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  42.72 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  39.62 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  35.81 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  35.81 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  34.88 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  36.32 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  34.08 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  34.08 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  33.49 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  33.91 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  33.98 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  31.9 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  32.42 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  38.31 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  32.54 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  31.78 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  33.68 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  30.45 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  30.18 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.41 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  38.35 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  30 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  38.28 
 
 		 133 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  32.3 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  31.53 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.53 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33.9 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  25.73 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  26.58 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  26.13 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  29.1 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  30.3 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  27.04 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  30.47 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  24.67 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  29 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  32.89 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  34.35 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  26.74 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.38 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  25.16 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  24.63 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  35.94 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  25.91 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6023  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 372 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.31 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  38.89 
 
 		 186 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>