More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1575 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  100 
 
 
262 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  83.97 
 
 
261 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  83.97 
 
 
261 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  80.53 
 
 
261 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  62.98 
 
 
260 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  62.21 
 
 
260 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  62.84 
 
 
260 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  65.43 
 
 
311 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  65.43 
 
 
261 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  63.49 
 
 
257 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  64.2 
 
 
261 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  65.02 
 
 
261 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  63.87 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  64.86 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  63.45 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  61.48 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  63.45 
 
 
256 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  61.09 
 
 
260 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  63.22 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  62.61 
 
 
266 aa  308  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  62.61 
 
 
256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  64.29 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  62.34 
 
 
259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  64.02 
 
 
256 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  61.39 
 
 
257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  61.76 
 
 
266 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  58.26 
 
 
281 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  58.4 
 
 
284 aa  287  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  57.02 
 
 
278 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  58.4 
 
 
284 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  60.16 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  59.76 
 
 
259 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  55.1 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  49.62 
 
 
257 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.66 
 
 
260 aa  266  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  49.62 
 
 
257 aa  265  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  49.24 
 
 
257 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  53.2 
 
 
273 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  50.77 
 
 
265 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  49.03 
 
 
256 aa  260  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  52.87 
 
 
259 aa  259  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  51.32 
 
 
261 aa  256  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  52.29 
 
 
259 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  49.43 
 
 
277 aa  255  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 
288 aa  253  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  51.49 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  51.49 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  51.49 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  51.49 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  49.81 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  51.49 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  52.94 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  51.12 
 
 
271 aa  251  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  52.99 
 
 
281 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  49.63 
 
 
277 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.99 
 
 
272 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50.99 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.37 
 
 
264 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  51.49 
 
 
271 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  52.59 
 
 
272 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  52.28 
 
 
278 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  49.02 
 
 
262 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  51.26 
 
 
274 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.57 
 
 
270 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  49.02 
 
 
262 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.06 
 
 
268 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  50.6 
 
 
270 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  49.02 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.19 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  52.12 
 
 
257 aa  244  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  52.94 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  48.59 
 
 
272 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  49.43 
 
 
270 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  52.96 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  52.57 
 
 
266 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  49.38 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  47.35 
 
 
271 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  53.63 
 
 
264 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  44.44 
 
 
259 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  48.09 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  48.74 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  48.09 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  44.06 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.69 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  49.17 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  52.24 
 
 
265 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  49.58 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  52.63 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  48.09 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  49.58 
 
 
270 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  51.42 
 
 
268 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  46.18 
 
 
258 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  46.18 
 
 
258 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  51.42 
 
 
268 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  48.47 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  46.54 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>