More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1537 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  60.98 
 
 		 615 aa  716    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  63.45 
 
 		 626 aa  761    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 593 aa  1193    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  62.98 
 
 		 617 aa  770    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  63.45 
 
 		 626 aa  761    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  62.02 
 
 		 624 aa  734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  53.59 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  44.73 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 624 aa  333  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.69 
 
 		 1023 aa  314  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  34.75 
 
 		 680 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 627 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  35.3 
 
 		 685 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  35.14 
 
 		 821 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.99 
 
 		 619 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  35.3 
 
 		 685 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.97 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.97 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.97 
 
 		 685 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  34.97 
 
 		 685 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  32.77 
 
 		 623 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 616 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 597 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 619 aa  266  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  32.94 
 
 		 621 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.22 
 
 		 613 aa  256  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.15 
 
 		 616 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 628 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 638 aa  248  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 613 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 698 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.81 
 
 		 631 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.15 
 
 		 631 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.83 
 
 		 615 aa  227  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 617 aa  226  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 602 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.87 
 
 		 631 aa  223  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 632 aa  220  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 735 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.48 
 
 		 623 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 634 aa  211  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 627 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  28.11 
 
 		 617 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 697 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  28.98 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  31.19 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.55 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  30.39 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 642 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 642 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 628 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 627 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.29 
 
 		 614 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 634 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  29.11 
 
 		 622 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.29 
 
 		 630 aa  193  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 670 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.38 
 
 		 618 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 621 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  30.49 
 
 		 611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.79 
 
 		 630 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.79 
 
 		 630 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 642 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.71 
 
 		 646 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 671 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.6 
 
 		 616 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.8 
 
 		 613 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  27.13 
 
 		 638 aa  170  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 618 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 628 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 673 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 690 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 655 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 625 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 680 aa  160  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 		 695 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 692 aa  158  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 662 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 656 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 659 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 647 aa  150  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 645 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>