155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1481 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  770    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  66.1 
 
 
366 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  48.16 
 
 
388 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  48.47 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  49.7 
 
 
367 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  47.69 
 
 
337 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  47.81 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  44.34 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  46.31 
 
 
488 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  46.07 
 
 
492 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  45.22 
 
 
481 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  51.24 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  44.76 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  48.5 
 
 
348 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  48.5 
 
 
348 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  43.27 
 
 
336 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  41.82 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.26 
 
 
370 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.82 
 
 
359 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  38.46 
 
 
362 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  41 
 
 
357 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  40.35 
 
 
361 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  40.35 
 
 
361 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  40.35 
 
 
361 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  41.3 
 
 
353 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  41.78 
 
 
358 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  40.35 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  40.35 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  40.35 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  39.52 
 
 
349 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  39.86 
 
 
353 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  39.63 
 
 
361 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  39.26 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  39.26 
 
 
331 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  39.26 
 
 
331 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  40.06 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  41.8 
 
 
358 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  38.51 
 
 
331 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  36.77 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  36.45 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  36.45 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.87 
 
 
385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  37.67 
 
 
352 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  36.81 
 
 
356 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.21 
 
 
349 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  35.89 
 
 
356 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  35.89 
 
 
356 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  34.04 
 
 
356 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  35.28 
 
 
356 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  59.33 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  59.33 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  59.33 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  59.33 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.34 
 
 
343 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.68 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  32.44 
 
 
329 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  33.11 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  32.25 
 
 
330 aa  133  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  30.98 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  33.84 
 
 
369 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  32.85 
 
 
338 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.87 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.28 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.97 
 
 
337 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.97 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  29.45 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  29.45 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  29.78 
 
 
360 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  29.79 
 
 
356 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  30.5 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  30.04 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  31.07 
 
 
363 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.38 
 
 
329 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  30.07 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  32.25 
 
 
332 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  29.05 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  30.83 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  31.95 
 
 
332 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29 
 
 
354 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  29.58 
 
 
362 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  29.82 
 
 
309 aa  106  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  29.58 
 
 
362 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  28.88 
 
 
317 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  30.08 
 
 
366 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  29.59 
 
 
328 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  29.25 
 
 
366 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.97 
 
 
366 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  31.06 
 
 
338 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  31.06 
 
 
366 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  27.18 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>