285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1437 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  80.66 
 
 
324 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  80 
 
 
324 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  75 
 
 
345 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  71.91 
 
 
339 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  68.56 
 
 
341 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  73.15 
 
 
410 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  66.44 
 
 
335 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  61.29 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  49.33 
 
 
330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  48.66 
 
 
331 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  48.99 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  46.98 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.32 
 
 
337 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.64 
 
 
328 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  47.99 
 
 
329 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  47.99 
 
 
329 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  47.99 
 
 
329 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  46.98 
 
 
329 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  46.98 
 
 
329 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.76 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  47.32 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  46.33 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  46.33 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  47.32 
 
 
330 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.98 
 
 
329 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  46.21 
 
 
299 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  46.31 
 
 
330 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.6 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  35.47 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.64 
 
 
384 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.64 
 
 
336 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  32.26 
 
 
392 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  29.77 
 
 
445 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  29.74 
 
 
426 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  29.1 
 
 
433 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.08 
 
 
366 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  28.44 
 
 
456 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.37 
 
 
1667 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 
317 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.23 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.46 
 
 
348 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.17 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.47 
 
 
580 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.99 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.38 
 
 
348 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 
347 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.18 
 
 
517 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  27.78 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  27.99 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 
406 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.74 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.99 
 
 
1094 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.89 
 
 
478 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.89 
 
 
478 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  24.09 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.16 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.17 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.15 
 
 
752 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  28.05 
 
 
971 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.17 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.83 
 
 
362 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.76 
 
 
819 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.1 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.97 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  24 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.4 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.89 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.51 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.13 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.57 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.83 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.06 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.35 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.58 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.86 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.83 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.45 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.07 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.38 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.83 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  22.83 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  22.62 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2106  hypothetical protein  21.05 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.07 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>