More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1419 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1419  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  100 
 
 		 483 aa  955    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.829241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1085  pseudouridine synthase  65.52 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  64.68 
 
 		 447 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5024  pseudouridine synthase  64.91 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0085  pseudouridine synthase  64.85 
 
 		 520 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.300201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2312  pseudouridine synthase, Rsu  65.11 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1867  pseudouridine synthase  62.8 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.919575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2613  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  76.21 
 
 		 544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0609714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2182  pseudouridine synthase  81.12 
 
 		 604 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2001  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  63.08 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.850732  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2873  pseudouridine synthase  69.32 
 
 		 736 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1114  pseudouridine synthase  51.4 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1207  pseudouridine synthase  51.4 
 
 		 594 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1759  RNA pseudouridine synthase family protein  50.99 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1737  RNA pseudouridine synthase family protein  50 
 
 		 554 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0207122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.68 
 
 		 615 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.57 
 
 		 631 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209025 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1912  RNA pseudouridylate synthase family protein  50 
 
 		 513 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0178  RNA pseudouridine synthase family protein  49.73 
 
 		 554 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0988  RNA pseudouridine synthase family protein  49.73 
 
 		 554 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1510  RNA pseudouridine synthase family protein  49.73 
 
 		 554 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1629  pseudouridine synthase  47.84 
 
 		 626 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1286  hypothetical protein  50.42 
 
 		 598 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0722025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1758  pseudouridine synthase  51.36 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324653  normal  0.0138956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4638  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  47.69 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2567  RNA pseudouridylate synthase family protein  48.49 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00446007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1732  pseudouridine synthase  51.88 
 
 		 597 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1016  pseudouridine synthase, Rsu  51.66 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.718536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1473  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.66 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1379  pseudouridine synthase, Rsu  52.5 
 
 		 572 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1497  pseudouridine synthase, Rsu  51.66 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1419  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.5 
 
 		 572 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0617825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2823  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.59 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1064  RNA pseudouridylate synthase family protein  51.98 
 
 		 380 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1230  pseudouridine synthase  52.73 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0560095  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1096  pseudouridine synthase  53.16 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1689  pseudouridine synthase  61.54 
 
 		 379 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0924391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2455  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  61.34 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1855  pseudouridine synthase, Rsu  56.33 
 
 		 315 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1872  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.46 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1957  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.29 
 
 		 345 aa  272  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1041  pseudouridine synthase, Rsu  52.45 
 
 		 268 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0593866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0646  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  54.47 
 
 		 315 aa  264  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.945317  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0608  pseudouridine synthase, Rsu  54.47 
 
 		 310 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.543804  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1258  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.85 
 
 		 296 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.919604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1691  pseudouridine synthase  53.91 
 
 		 288 aa  257  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  55.02 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1470  RNA-binding S4 domain protein  55.02 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.177762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1722  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.79 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.950771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2039  23S rRNA pseudouridylate synthase B  51.43 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2907  pseudouridine synthase  53.33 
 
 		 287 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.191084  normal  0.0790045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2246  pseudouridine synthase  53.31 
 
 		 293 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1928  23S rRNA pseudouridylate synthase B  51.43 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.521525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2309  23S rRNA pseudouridylate synthase B  51.43 
 
 		 344 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1951  hypothetical protein  53.53 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0106658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1467  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.89 
 
 		 291 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.807732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1533  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.89 
 
 		 291 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000439021  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1648  pseudouridine synthase  52.89 
 
 		 290 aa  250  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000180778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2436  pseudouridine synthase, Rsu  52.48 
 
 		 290 aa  250  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1525  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.48 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2662  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 299 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.783064  hitchhiker  0.000000512691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2824  pseudouridine synthase, Rsu  50.4 
 
 		 289 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1594  hypothetical protein  52.87 
 
 		 248 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2169  23S rRNA pseudouridylate synthase B  53.59 
 
 		 301 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.310222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23110  hypothetical protein  52.7 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2124  pseudouridine synthase, Rsu  52.89 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.380507  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1402  hypothetical protein  52.46 
 
 		 248 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2398  pseudouridine synthase  52.89 
 
 		 291 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0731299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1901  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 290 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000316134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0851  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.46 
 
 		 286 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000682568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1467  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 290 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01245  23S rRNA pseudouridylate synthase  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2380  pseudouridine synthase  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.227728  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1378  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01255  hypothetical protein  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2359  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.666226  hitchhiker  0.000000402657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1864  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 291 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000661811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1929  23S rRNA pseudouridylate synthase B  52.74 
 
 		 289 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2717  pseudouridine synthase  52.48 
 
 		 291 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.374808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1493  23S rRNA pseudouridylate synthase B  56.09 
 
 		 290 aa  246  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2796  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.48 
 
 		 291 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1089  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  53.7 
 
 		 290 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1427  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 291 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.535105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1909  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 291 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000521291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1669  RNA-binding S4 domain protein  52.48 
 
 		 291 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00289659  hitchhiker  0.000456402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1609  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 291 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1851  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 291 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2696  pseudouridine synthase  52.48 
 
 		 291 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.764496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1846  23S rRNA pseudouridylate synthase B  55.65 
 
 		 291 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539759  hitchhiker  0.0000324002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2010  23S rRNA pseudouridylate synthase B  53.28 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2311  23S rRNA pseudouridylate synthase B  53.28 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.909741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3394  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.42 
 
 		 300 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000468714  normal  0.359184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1437  pseudouridine synthase, Rsu  52.07 
 
 		 290 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2201  23S rRNA pseudouridylate synthase B  54.78 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1841  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.45 
 
 		 385 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0877  RNA pseudouridine synthase family protein  52.99 
 
 		 244 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3519  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  50.83 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  52.56 
 
 		 244 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3581  pseudouridine synthase, Rsu  51.45 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1815  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  51.45 
 
 		 408 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>