42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1398 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1252  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  29.42 
 
 
608 aa  272  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  22.11 
 
 
453 aa  75.5  3e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.98 
 
 
440 aa  65.9  2e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  41.03 
 
 
418 aa  65.1  3e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  45.33 
 
 
422 aa  64.3  7e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  36 
 
 
414 aa  63.2  1e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  42.31 
 
 
421 aa  62.8  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  36.99 
 
 
415 aa  62.8  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  34.04 
 
 
369 aa  61.6  4e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  35.96 
 
 
430 aa  61.6  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  32.26 
 
 
736 aa  61.2  5e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  30.72 
 
 
410 aa  60.1  1e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  35.43 
 
 
769 aa  59.3  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  26.74 
 
 
410 aa  56.6  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  39.76 
 
 
423 aa  56.6  1e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  34.94 
 
 
577 aa  56.6  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  35.37 
 
 
709 aa  56.2  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  56.1 
 
 
445 aa  55.8  2e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  38.55 
 
 
422 aa  55.1  3e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  30.1 
 
 
427 aa  55.5  3e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.06 
 
 
452 aa  55.1  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  36.84 
 
 
408 aa  54.7  5e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  28.87 
 
 
445 aa  54.3  6e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  39.44 
 
 
454 aa  53.9  9e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  33.96 
 
 
482 aa  53.5  1e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  36.04 
 
 
464 aa  53.1  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  39.24 
 
 
439 aa  53.5  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  37.84 
 
 
449 aa  52  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  33.73 
 
 
360 aa  51.6  5e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  31.13 
 
 
420 aa  50.8  8e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  36.14 
 
 
478 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.62 
 
 
203 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  37.84 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.09 
 
 
634 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.8 
 
 
464 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  30.77 
 
 
442 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  26.76 
 
 
452 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
406 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.1 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>