17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1368 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1368  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0029518  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0947  hypothetical protein  66.05 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1029  hypothetical protein  65.12 
 
 
241 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0724  hypothetical protein  52.58 
 
 
229 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480044  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3526  hypothetical protein  45.18 
 
 
240 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3884  hypothetical protein  44.89 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035033  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2050  hypothetical protein  43.98 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2393  hypothetical protein  32.2 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1563  hypothetical protein  30.39 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00766296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2281  hypothetical protein  37.8 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5330  hypothetical protein  34.78 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2976  hypothetical protein  23.79 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0640224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.88 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6790  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  27.8 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43994  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1309  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718075  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03813  hypothetical protein  26.88 
 
 
309 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0783  polyferredoxin-like protein  31.87 
 
 
336 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>