More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1365 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  74.32 
 
 
481 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  68.62 
 
 
479 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  75.31 
 
 
480 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  71.76 
 
 
480 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  74.32 
 
 
481 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  74.32 
 
 
481 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 
479 aa  965    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  84.97 
 
 
478 aa  788    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  81.42 
 
 
505 aa  811    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  75.1 
 
 
481 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  75.1 
 
 
481 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  84.76 
 
 
478 aa  800    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  77.66 
 
 
478 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  74.11 
 
 
481 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  74.74 
 
 
481 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  76.15 
 
 
482 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  74.11 
 
 
481 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  75.16 
 
 
481 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  64.06 
 
 
476 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  62.95 
 
 
482 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.87 
 
 
476 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  62 
 
 
477 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  62 
 
 
477 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.26 
 
 
478 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  62.45 
 
 
480 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  62 
 
 
478 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  62.61 
 
 
477 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  61.31 
 
 
477 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
477 aa  578  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  60.47 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  60.08 
 
 
481 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
477 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
477 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
475 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
485 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  52.21 
 
 
475 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.59 
 
 
476 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
496 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
475 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.53 
 
 
477 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  50.85 
 
 
477 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.9 
 
 
478 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
495 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  50.94 
 
 
477 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
493 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  48.18 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
477 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50 
 
 
477 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
487 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.44 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
485 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
485 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.46 
 
 
483 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  45.62 
 
 
483 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.64 
 
 
480 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.13 
 
 
483 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
483 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
487 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.64 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.13 
 
 
483 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.13 
 
 
483 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.91 
 
 
483 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
493 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.64 
 
 
480 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
484 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.52 
 
 
480 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.91 
 
 
483 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  42.13 
 
 
486 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.13 
 
 
483 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.64 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.7 
 
 
483 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.7 
 
 
483 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
482 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.37 
 
 
482 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.7 
 
 
483 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.37 
 
 
482 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
486 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
478 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
494 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
483 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
493 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
500 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.96 
 
 
482 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.52 
 
 
482 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.96 
 
 
482 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.16 
 
 
482 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  40.96 
 
 
482 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
485 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.96 
 
 
482 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.83 
 
 
483 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.52 
 
 
482 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.52 
 
 
482 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
488 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
485 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>