196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1291 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  56.9 
 
 
884 aa  795    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  58.58 
 
 
855 aa  786    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  54.32 
 
 
867 aa  719    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  63.98 
 
 
877 aa  855    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  56.63 
 
 
868 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  100 
 
 
866 aa  1642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  58.12 
 
 
857 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  63.52 
 
 
877 aa  856    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  55.31 
 
 
844 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  52.97 
 
 
853 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  42.82 
 
 
858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  43.17 
 
 
857 aa  492  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  43.94 
 
 
846 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  40.99 
 
 
855 aa  482  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  36.33 
 
 
835 aa  322  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
835 aa  322  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.57 
 
 
849 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.49 
 
 
850 aa  210  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.57 
 
 
858 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.11 
 
 
870 aa  198  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 
847 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  38.13 
 
 
408 aa  196  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 
847 aa  187  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.06 
 
 
866 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.59 
 
 
851 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  39.8 
 
 
445 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.88 
 
 
855 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.48 
 
 
850 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
845 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.74 
 
 
841 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.24 
 
 
843 aa  154  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 
839 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  35.55 
 
 
842 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.27 
 
 
849 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
848 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
837 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 
842 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
849 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.78 
 
 
842 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
852 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
846 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.24 
 
 
843 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.56 
 
 
847 aa  90.1  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  22.32 
 
 
817 aa  89.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.57 
 
 
855 aa  89  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.14 
 
 
817 aa  84  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 
856 aa  83.2  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.06 
 
 
817 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.5 
 
 
845 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 
855 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  21.38 
 
 
836 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  23.26 
 
 
879 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.84 
 
 
820 aa  72.4  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 
855 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.74 
 
 
825 aa  72  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  21.45 
 
 
850 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.04 
 
 
843 aa  70.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.9 
 
 
857 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.26 
 
 
836 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  24.36 
 
 
793 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
839 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.53 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
834 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  21.78 
 
 
836 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.04 
 
 
841 aa  66.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  24.01 
 
 
826 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  20.92 
 
 
840 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  25.58 
 
 
821 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  29.49 
 
 
827 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.27 
 
 
842 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
930 aa  63.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  23.22 
 
 
887 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
806 aa  61.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  25.35 
 
 
820 aa  61.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.83 
 
 
399 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
861 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  22.93 
 
 
889 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 
853 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.07 
 
 
889 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  30.97 
 
 
804 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 
884 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  22.64 
 
 
887 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  28.32 
 
 
795 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
821 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.16 
 
 
856 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  24.29 
 
 
821 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  24.65 
 
 
889 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  23.38 
 
 
836 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25 
 
 
404 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.27 
 
 
878 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.66 
 
 
835 aa  57.4  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  27.36 
 
 
819 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.37 
 
 
825 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  32.84 
 
 
873 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
866 aa  55.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.57 
 
 
402 aa  55.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
402 aa  55.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 
838 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5621  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 
843 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.458246  normal  0.150773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  25.19 
 
 
819 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>