More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1261 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  81.85 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  81.45 
 
 		 250 aa  374  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  79.84 
 
 		 270 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  75.5 
 
 		 247 aa  358  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5182  triosephosphate isomerase  80.65 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  76.19 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  65.46 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3258  triosephosphate isomerase  76.5 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1422  triosephosphate isomerase  71.49 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.192091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  63.45 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  60.47 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  56.8 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  60.24 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  58.54 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  59.84 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  58.13 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  59.36 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  59.68 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  58.66 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  60.87 
 
 		 251 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  57.83 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  54.98 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 259 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  56.49 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  56.45 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  57.61 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  58.17 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  52.19 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 249 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  48.84 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  47.49 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  53.66 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.95 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 260 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  51.41 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 650 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>