241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1202 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  62.05 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  64.95 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  68.5 
 
 		 222 aa  244  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  62.96 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  56.04 
 
 		 195 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  55.11 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  61.18 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  58.29 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  58.29 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  56.98 
 
 		 193 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  56.22 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  53.89 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  64.16 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  64.16 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  51.31 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  34.48 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.84 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  31.07 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  26.04 
 
 		 176 aa  72  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  33.59 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  33.59 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  28.9 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  34.69 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  35 
 
 		 197 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  33.05 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  33.09 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  33.61 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  25.7 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 		 494 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  32.38 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  27.13 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  25.15 
 
 		 563 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  25.15 
 
 		 532 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  27.48 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.39 
 
 		 534 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 459 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.98 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 445 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 479 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 533 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.35 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.35 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.68 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  26.03 
 
 		 624 aa  52.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  28.34 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  32.11 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.25 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  32.11 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  24.24 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 429 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.76 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  24.75 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  32.99 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  32.99 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  32.99 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 1105 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 561 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 489 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 293 aa  48.5  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 307 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 389 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 362 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  22.9 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 572 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.53 
 
 		 633 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>