82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1176 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
125 aa  261  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.07 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  76.92 
 
 
125 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.92 
 
 
125 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.23 
 
 
123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  68.38 
 
 
121 aa  180  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.49 
 
 
126 aa  178  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  69.23 
 
 
121 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  65.81 
 
 
121 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  50.42 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.7 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.78 
 
 
130 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  47.9 
 
 
136 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  51.33 
 
 
138 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  52.38 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  44.88 
 
 
133 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.09 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.02 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.37 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.31 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.02 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  42.62 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.31 
 
 
133 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  43.31 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.31 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.06 
 
 
134 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  42.5 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  46.6 
 
 
116 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  43.69 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.26 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  39.22 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.26 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.74 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  40.26 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.54 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  36.71 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.64 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  39.24 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.8 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.77 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.26 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  37.63 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  34.18 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  42.62 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
217 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  35.23 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.32 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  44.83 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.84 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.92 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.09 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  34.18 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  32.89 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  32.61 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
111 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  28.79 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.18 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.94 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.63 
 
 
138 aa  40  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>