18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1137 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  907    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  80.77 
 
 		 394 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  75.64 
 
 		 400 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  51.58 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  52.11 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  31.8 
 
 		 698 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  28.5 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  29.33 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  25.91 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  21.09 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  33.55 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  24.09 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  31.03 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  25.34 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  27.95 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.51 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  26.71 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  22.74 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>