More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1007 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  70.22 
 
 
231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  67.38 
 
 
233 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  67.56 
 
 
232 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  67.1 
 
 
255 aa  322  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  65.78 
 
 
234 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  69.91 
 
 
239 aa  307  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  63.64 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  60.53 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  49.78 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  48.02 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  49.34 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  48.02 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  49.78 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  47.58 
 
 
235 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  48.9 
 
 
237 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  48.9 
 
 
261 aa  207  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  48.44 
 
 
241 aa  207  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  46.35 
 
 
250 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  47.56 
 
 
241 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  51.11 
 
 
237 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  43.91 
 
 
236 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  44.54 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  40.44 
 
 
231 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  42.73 
 
 
234 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  44.35 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  43.17 
 
 
232 aa  187  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  39.21 
 
 
231 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  45.61 
 
 
238 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  43.91 
 
 
233 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  39.3 
 
 
228 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  42.29 
 
 
236 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  46.32 
 
 
226 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  45.5 
 
 
216 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  43.04 
 
 
235 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  38.77 
 
 
230 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  38.77 
 
 
230 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  38.05 
 
 
230 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  38.53 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  48.75 
 
 
165 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  37.72 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  40.35 
 
 
222 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  31.11 
 
 
461 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  44.65 
 
 
174 aa  134  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  37.39 
 
 
315 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  39.61 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  36.36 
 
 
235 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  36.61 
 
 
220 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  43.62 
 
 
321 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  33.49 
 
 
287 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  32.47 
 
 
226 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  38.57 
 
 
316 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  42.95 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  30.84 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  39.1 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  34.41 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  41.22 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  32.37 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  37.14 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  40.54 
 
 
312 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  44.9 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  33.64 
 
 
312 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  35.44 
 
 
322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  41.5 
 
 
251 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  37.08 
 
 
325 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  40.4 
 
 
320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  41.78 
 
 
321 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  35.35 
 
 
226 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  41.1 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  42.55 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  33.7 
 
 
289 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  40.69 
 
 
287 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  40.14 
 
 
325 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1541  hypothetical protein  30.17 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.463797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  39.16 
 
 
326 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  37.5 
 
 
321 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  29.82 
 
 
221 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  39.73 
 
 
325 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  36.17 
 
 
252 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  38.26 
 
 
321 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  37.82 
 
 
323 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  41.33 
 
 
326 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  33.17 
 
 
321 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  38.67 
 
 
324 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  33.17 
 
 
327 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  39.47 
 
 
334 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  33.17 
 
 
321 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>