More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0932 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0932  porin  100 
 
 		 344 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  75.69 
 
 		 362 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  70.99 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  67.9 
 
 		 351 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  43.31 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  39.18 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  39.08 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  41.57 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  40.33 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  41.94 
 
 		 385 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  41.81 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  39.14 
 
 		 414 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  40.79 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  38.92 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  37.54 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  35.85 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  38.46 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  39.89 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  36.8 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  34.42 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  35.77 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  37.4 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  33.96 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  32.84 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.97 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  36.14 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  34.27 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.77 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  35.95 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  34.3 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  35.9 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  32.67 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  32.67 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.79 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  32.39 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.24 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.15 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.15 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.15 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.15 
 
 		 449 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.15 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.15 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  34.6 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.54 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.79 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.25 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  30.08 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  34.14 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  32.39 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.76 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.76 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  33.33 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  33.06 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  34.44 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  30.45 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  33.25 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  33.51 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  36.5 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  33.07 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  31.97 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.48 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  31.25 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.25 
 
 		 368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33.23 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  35.65 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.8 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  30.93 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  33.53 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  33.06 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.5 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  32.85 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  33.82 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  30.75 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  34.01 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  33.52 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  32.69 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  33.72 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  31.5 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  33.72 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  31.98 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.22 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  33.72 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  30.66 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  32 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.6 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  29.87 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.78 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.88 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  31.27 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  31.46 
 
 		 386 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  29.77 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  31.87 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.36 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.36 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.36 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  31.51 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.06 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.36 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>