31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0774 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  100 
 
 
399 aa  788  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  69.23 
 
 
381 aa  458  1e-128  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  68.95 
 
 
381 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  62.18 
 
 
369 aa  400  1e-110  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  62.39 
 
 
374 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  56.91 
 
 
442 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  61.49 
 
 
384 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  59.83 
 
 
360 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  57.85 
 
 
363 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  55.98 
 
 
357 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  51.49 
 
 
384 aa  322  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  49.73 
 
 
379 aa  320  2e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  52.44 
 
 
365 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  50.67 
 
 
365 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  48.25 
 
 
385 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  44.96 
 
 
376 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  42.77 
 
 
351 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  45.24 
 
 
353 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  44.44 
 
 
357 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.75774e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  43.6 
 
 
387 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  41.85 
 
 
363 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  42.11 
 
 
351 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  43.4 
 
 
363 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  41.36 
 
 
385 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  43.33 
 
 
355 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  38.26 
 
 
356 aa  213  4e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  43.8 
 
 
375 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  43.75 
 
 
336 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  31.19 
 
 
343 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  7.16532e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  25.4 
 
 
340 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  29.97 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>