More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0762 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  68.01 
 
 
535 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  83.18 
 
 
553 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  79.46 
 
 
535 aa  783    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  68.29 
 
 
551 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  67.37 
 
 
532 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 
560 aa  1084    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  66.09 
 
 
539 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  50.86 
 
 
549 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  49.9 
 
 
526 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  48.35 
 
 
543 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  45.3 
 
 
553 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  45.5 
 
 
542 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  45.95 
 
 
535 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  45.23 
 
 
528 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  45.79 
 
 
529 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  43.1 
 
 
532 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  45.96 
 
 
549 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  46.36 
 
 
539 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  42.91 
 
 
532 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  43.39 
 
 
549 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  46.64 
 
 
529 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  39.27 
 
 
586 aa  346  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  40.95 
 
 
530 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  39.21 
 
 
536 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  40.42 
 
 
539 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  39.02 
 
 
536 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  38.64 
 
 
542 aa  324  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  38.45 
 
 
542 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  41.14 
 
 
529 aa  320  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  39.77 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  37.22 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  39.34 
 
 
542 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  39.73 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  40.23 
 
 
569 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  40.23 
 
 
569 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  38.34 
 
 
542 aa  306  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  39.61 
 
 
574 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  37.24 
 
 
551 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  40.45 
 
 
541 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  35.38 
 
 
542 aa  299  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.32 
 
 
544 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  39.92 
 
 
533 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  39.92 
 
 
533 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  39.92 
 
 
533 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  36.46 
 
 
562 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  35.5 
 
 
562 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  37.6 
 
 
543 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  35.35 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34 
 
 
571 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.46 
 
 
532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.92 
 
 
572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  35.79 
 
 
560 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  38.91 
 
 
541 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  35.11 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  38.91 
 
 
541 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  34.93 
 
 
555 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  39.22 
 
 
561 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  36.36 
 
 
562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  39.58 
 
 
419 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  36.27 
 
 
533 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  36.05 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  38.95 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  37.47 
 
 
433 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
433 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  37.22 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  37.22 
 
 
429 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  37.22 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  37.22 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  37.22 
 
 
433 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.81 
 
 
424 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
440 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
442 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
419 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
433 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.97 
 
 
418 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.69 
 
 
436 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  33 
 
 
474 aa  144  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.34 
 
 
474 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.02 
 
 
418 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
461 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
432 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.83 
 
 
447 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.87 
 
 
452 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
423 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
435 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.82 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
433 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.62 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.68 
 
 
430 aa  133  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  32.4 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  31.54 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.65 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  33.06 
 
 
425 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>