238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0676 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  100 
 
 
712 aa  1445    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  46.59 
 
 
703 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  26.64 
 
 
594 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.43 
 
 
613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.2 
 
 
598 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  25.9 
 
 
596 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.13 
 
 
594 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.17 
 
 
623 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.24 
 
 
695 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  23.69 
 
 
758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.51 
 
 
650 aa  107  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.98 
 
 
553 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.39 
 
 
615 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.19 
 
 
637 aa  90.5  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.11 
 
 
594 aa  88.2  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  31.41 
 
 
596 aa  83.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.61 
 
 
793 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.59 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  25.2 
 
 
763 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  28.08 
 
 
607 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  29.51 
 
 
682 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  25.54 
 
 
769 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.75 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.99 
 
 
640 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  27.71 
 
 
748 aa  74.3  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  22.63 
 
 
691 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  26.16 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.25 
 
 
762 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.81 
 
 
807 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  28.05 
 
 
782 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.58 
 
 
689 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.31 
 
 
780 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  26.76 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  26.2 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  24.85 
 
 
728 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.48 
 
 
669 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.42 
 
 
666 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.31 
 
 
546 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  28.33 
 
 
744 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.23 
 
 
707 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.33 
 
 
773 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 
574 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  25.19 
 
 
569 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  25.19 
 
 
569 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.89 
 
 
677 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.89 
 
 
677 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.56 
 
 
645 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  22.66 
 
 
598 aa  60.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  28.44 
 
 
696 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  21.68 
 
 
598 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.3 
 
 
674 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  33.11 
 
 
522 aa  58.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.53 
 
 
688 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.11 
 
 
564 aa  57.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  20.48 
 
 
600 aa  57.4  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.91 
 
 
589 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  20.71 
 
 
641 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  29.32 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  25.57 
 
 
554 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  22.39 
 
 
541 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  43.28 
 
 
391 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  34.78 
 
 
368 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  31.34 
 
 
552 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  35.96 
 
 
537 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  23.11 
 
 
619 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  40.58 
 
 
379 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  42.86 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.38 
 
 
595 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  40.68 
 
 
357 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  42.86 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  38.82 
 
 
373 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.51 
 
 
642 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.65 
 
 
415 aa  52.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 
457 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  44.29 
 
 
375 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.32 
 
 
552 aa  52.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.04 
 
 
669 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.79 
 
 
648 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 
566 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  42.86 
 
 
375 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  20 
 
 
606 aa  51.6  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>