More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0659 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  80.39 
 
 
436 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  87.13 
 
 
440 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  77.78 
 
 
418 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  84.47 
 
 
420 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  85.85 
 
 
435 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  85.14 
 
 
435 aa  736    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  85.23 
 
 
417 aa  718    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
428 aa  856    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  68.77 
 
 
420 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  66.43 
 
 
426 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66.43 
 
 
426 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  67.15 
 
 
422 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  67.31 
 
 
426 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66.43 
 
 
426 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66.43 
 
 
426 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66.43 
 
 
426 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66.43 
 
 
426 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  65.65 
 
 
438 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  67.65 
 
 
409 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  65.65 
 
 
438 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  64.09 
 
 
417 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  64.22 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  65.76 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  65.23 
 
 
429 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  61.85 
 
 
418 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  62.41 
 
 
409 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  61.16 
 
 
439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  55.23 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  58.21 
 
 
421 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  58.11 
 
 
421 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  58.54 
 
 
422 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  56.21 
 
 
428 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  56.65 
 
 
424 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  55.66 
 
 
424 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  55.58 
 
 
424 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  55.42 
 
 
424 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  53.61 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  53.83 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  48.21 
 
 
912 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  48.77 
 
 
895 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  48.07 
 
 
441 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  48 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  49.27 
 
 
443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  46.59 
 
 
905 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  46.42 
 
 
917 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  47.98 
 
 
453 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
460 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  49.63 
 
 
460 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  45.04 
 
 
452 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  38.76 
 
 
431 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  48.74 
 
 
459 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  43 
 
 
402 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  40.1 
 
 
424 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 
413 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  39.7 
 
 
424 aa  298  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  45.15 
 
 
893 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  47.54 
 
 
424 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 
422 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
444 aa  276  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  39.2 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  39.49 
 
 
472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  33.4 
 
 
494 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
506 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  37.87 
 
 
411 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  33.87 
 
 
404 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  33.92 
 
 
411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.12 
 
 
404 aa  176  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  30.15 
 
 
389 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.49 
 
 
389 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.9 
 
 
389 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.9 
 
 
389 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.69 
 
 
403 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.9 
 
 
389 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.9 
 
 
389 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.9 
 
 
389 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.65 
 
 
389 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.9 
 
 
389 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.9 
 
 
389 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
397 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
398 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  31.31 
 
 
403 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  31.72 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 
419 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  29.95 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.41 
 
 
403 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
395 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  31.23 
 
 
403 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.27 
 
 
423 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
406 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
403 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  31.78 
 
 
403 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
382 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  31.78 
 
 
411 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  30.97 
 
 
412 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  31.57 
 
 
405 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  29.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  29.87 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  31.3 
 
 
414 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>