More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0591 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  58.86 
 
 		 302 aa  349  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  57.53 
 
 		 313 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 485 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  53.17 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 600 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 307 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  48.16 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 532 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 430 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  26.79 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  38.52 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  38.52 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  28.9 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  24.73 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 506 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.03 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  28.9 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  28.9 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  28.9 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  28.9 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  29 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.5 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.36 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  40.24 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 538 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  28 
 
 		 507 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.63 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  25.45 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.4 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  22.87 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  21.22 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  25.45 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  22.95 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.98 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.14 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  22.62 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 519 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.71 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.71 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.71 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  19.92 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>