More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0570 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  40.6 
 
 
324 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  39.93 
 
 
318 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  39.6 
 
 
318 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  37.25 
 
 
334 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 
312 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.53 
 
 
312 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  34.63 
 
 
300 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  33.44 
 
 
317 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  37.86 
 
 
327 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  37.21 
 
 
313 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  38.4 
 
 
313 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.14 
 
 
305 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  35.58 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  34.81 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  31.99 
 
 
312 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  32.66 
 
 
338 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.45 
 
 
314 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  35.15 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  33.22 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.88 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  34.88 
 
 
319 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  36.1 
 
 
281 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  33.68 
 
 
305 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  34.96 
 
 
298 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  40.94 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.76 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  32.57 
 
 
333 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  39.22 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.45 
 
 
317 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.81 
 
 
292 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  33.68 
 
 
292 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  36.07 
 
 
313 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  32.08 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  33.45 
 
 
299 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  33.45 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  33.8 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  33.57 
 
 
292 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  33.97 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  33.46 
 
 
288 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  30.61 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  34.04 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  33.59 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  33.07 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  33.97 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  33.07 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  33.07 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  33.97 
 
 
296 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 
313 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.78 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  35.47 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.01 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.2 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  31.92 
 
 
311 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  31.49 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.05 
 
 
317 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.33 
 
 
307 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  29.09 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.43 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  35.04 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  35.87 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  33.56 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.71 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  31 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.4 
 
 
312 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
289 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  31.84 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 
290 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  32.36 
 
 
298 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  31.84 
 
 
295 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  29.49 
 
 
306 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  23.02 
 
 
302 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.37 
 
 
302 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.63 
 
 
317 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.98 
 
 
301 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  32 
 
 
277 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  34.1 
 
 
295 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.21 
 
 
317 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  30.99 
 
 
287 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.93 
 
 
304 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.83 
 
 
302 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
318 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
329 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.27 
 
 
285 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  32.07 
 
 
307 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.06 
 
 
316 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  32.13 
 
 
302 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.66 
 
 
302 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>