186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0483 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1204    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  90.22 
 
 		 1604 aa  907    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  99.6 
 
 		 1583 aa  944    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1229 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.4 
 
 		 1446 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  35.9 
 
 		 1385 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1400 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1411 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  33.46 
 
 		 1409 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  32.35 
 
 		 1140 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.48 
 
 		 1421 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  33.85 
 
 		 855 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1390 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1402 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1418 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  33.94 
 
 		 1359 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1386 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1410 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1654 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  30.71 
 
 		 1379 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1419 aa  134  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1531 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  30.32 
 
 		 1530 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  32.16 
 
 		 1150 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  30.66 
 
 		 1428 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.26 
 
 		 1348 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  30.59 
 
 		 1150 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  30.59 
 
 		 1150 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1150 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  30.83 
 
 		 1362 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  29.95 
 
 		 1447 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.85 
 
 		 1586 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  29.2 
 
 		 1568 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1317 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1149 aa  93.6  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  30.24 
 
 		 1422 aa  94  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1319 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  29 
 
 		 1475 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  28.98 
 
 		 1429 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1770 aa  90.9  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.39 
 
 		 1981 aa  90.5  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1149 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1554 aa  88.2  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  28.28 
 
 		 1457 aa  87.8  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1679 aa  87.8  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  28.65 
 
 		 1423 aa  87  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1677 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  28.2 
 
 		 1494 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1494 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1487 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1547 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1520 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1600 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1505 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  29.1 
 
 		 1528 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.89 
 
 		 1518 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  26.39 
 
 		 1308 aa  81.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  26.65 
 
 		 1388 aa  81.6  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  28.98 
 
 		 1517 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1550 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  26.39 
 
 		 1399 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  33.09 
 
 		 1508 aa  80.5  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  26.65 
 
 		 1409 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  26.39 
 
 		 1394 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  41.82 
 
 		 1791 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1251 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1490 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1527 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  25.56 
 
 		 1437 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  28.77 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1397 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1551 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1411 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  26.8 
 
 		 1410 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  27.85 
 
 		 1401 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.41 
 
 		 1543 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1552 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1495 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  26.12 
 
 		 1411 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  26.12 
 
 		 1411 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1377 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  26.12 
 
 		 1377 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  27.45 
 
 		 1616 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  26.8 
 
 		 1417 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.12 
 
 		 1415 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  29.89 
 
 		 1539 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  32.93 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  25.86 
 
 		 1411 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  25.86 
 
 		 1411 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1397 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1411 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  25.86 
 
 		 1397 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  25.92 
 
 		 1426 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1426 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1268 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  28.14 
 
 		 1388 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  25.97 
 
 		 1398 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  25.65 
 
 		 1426 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  30.53 
 
 		 1539 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>