48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0458 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0458  leucine-rich repeat-containing ribonuclease inhibitor  100 
 
 
516 aa  975    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363451  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  37.83 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  35.93 
 
 
620 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  35.59 
 
 
522 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  35.52 
 
 
661 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  41.47 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  31.1 
 
 
647 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  33.1 
 
 
981 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02003  GALA protein  34.96 
 
 
518 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128117  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  35.24 
 
 
400 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.8 
 
 
344 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  26.4 
 
 
815 aa  89.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.9 
 
 
474 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  30.5 
 
 
770 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  27.41 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  30.5 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  30.67 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  31.31 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  22.96 
 
 
781 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  29.46 
 
 
692 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  27.69 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  28.63 
 
 
510 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  32.93 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.92 
 
 
1107 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1857  hypothetical protein  25.7 
 
 
553 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  30.32 
 
 
897 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0110  hypothetical protein  38.62 
 
 
254 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1852  hypothetical protein  25.44 
 
 
553 aa  57.4  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.16 
 
 
1351 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0526  hypothetical protein  28.44 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  33.04 
 
 
175 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0729  hypothetical protein  23.11 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.13 
 
 
1655 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  26.56 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  27.99 
 
 
916 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  25.48 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  27.24 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.22 
 
 
1344 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  27.78 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0025  cyclin domain-containing protein  31.9 
 
 
807 aa  47.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.17 
 
 
531 aa  47.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  27.65 
 
 
935 aa  47  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88061  predicted protein  27.61 
 
 
936 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  25.12 
 
 
591 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  24.22 
 
 
1088 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  25.72 
 
 
404 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  31.28 
 
 
643 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  23.91 
 
 
972 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>