More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0453 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 
352 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  44.38 
 
 
359 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  43.66 
 
 
352 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  43.36 
 
 
352 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  44.51 
 
 
360 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  42.09 
 
 
357 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  44.35 
 
 
357 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  42.6 
 
 
420 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  42.6 
 
 
420 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  42.26 
 
 
399 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  42.77 
 
 
352 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  42.48 
 
 
352 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  42.48 
 
 
352 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  41.44 
 
 
360 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  42.31 
 
 
420 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  42.31 
 
 
420 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.68 
 
 
360 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.61 
 
 
363 aa  209  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.26 
 
 
355 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  34.49 
 
 
351 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  35.28 
 
 
369 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  36.34 
 
 
354 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.59 
 
 
354 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.75 
 
 
354 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3443  type III secretion exporter  37.98 
 
 
358 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.942918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.04 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  34.28 
 
 
355 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  34.28 
 
 
356 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  34.28 
 
 
355 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.13 
 
 
357 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  33.72 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.99 
 
 
352 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  36.24 
 
 
346 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.71 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.28 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.2 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.06 
 
 
346 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  36.41 
 
 
361 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.01 
 
 
381 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.47 
 
 
376 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.54 
 
 
383 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.49 
 
 
373 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 
380 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.88 
 
 
357 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.54 
 
 
358 aa  188  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.89 
 
 
374 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 
362 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  35.57 
 
 
359 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.43 
 
 
368 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
377 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
406 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.87 
 
 
366 aa  185  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.22 
 
 
403 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
378 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.26 
 
 
377 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.21 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.06 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.81 
 
 
398 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.24 
 
 
359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.12 
 
 
351 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.86 
 
 
353 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.2 
 
 
359 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  34.2 
 
 
349 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  32.49 
 
 
345 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1450  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
376 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.81 
 
 
399 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.15 
 
 
376 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.31 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.81 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.89 
 
 
399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.89 
 
 
399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2938  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.08 
 
 
380 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0481554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  34.82 
 
 
359 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.81 
 
 
405 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.92 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
401 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
401 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
401 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  34.94 
 
 
363 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
405 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.91 
 
 
353 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  33.82 
 
 
390 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.42 
 
 
377 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.97 
 
 
359 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2913  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.58 
 
 
376 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847075  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
387 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
387 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
376 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
405 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.25 
 
 
401 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.24 
 
 
377 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.08 
 
 
411 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.75 
 
 
360 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
354 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  33.82 
 
 
349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
350 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
401 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27920  flagellar biosynthetic protein  34.25 
 
 
402 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>