More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0323 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
556 aa  1089    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.72 
 
 
517 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  63.72 
 
 
517 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  60.88 
 
 
504 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  64.47 
 
 
493 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  62.63 
 
 
480 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  57.99 
 
 
483 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  45.48 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.91 
 
 
491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.02 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.28 
 
 
509 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  40.75 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.24 
 
 
502 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  44.51 
 
 
519 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.28 
 
 
498 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.28 
 
 
498 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.77 
 
 
498 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  43.24 
 
 
502 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.69 
 
 
498 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  43.24 
 
 
502 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
498 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
493 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.82 
 
 
502 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.35 
 
 
498 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.35 
 
 
514 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
514 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.06 
 
 
502 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.35 
 
 
498 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.35 
 
 
498 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
527 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.77 
 
 
498 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.52 
 
 
515 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.28 
 
 
498 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.45 
 
 
515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.15 
 
 
490 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  44.08 
 
 
504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.58 
 
 
514 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.49 
 
 
504 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.49 
 
 
604 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.76 
 
 
699 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.05 
 
 
702 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.51 
 
 
490 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
552 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.56 
 
 
474 aa  246  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  41.34 
 
 
514 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
615 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  41.77 
 
 
585 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
593 aa  239  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
594 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
582 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
576 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  41.77 
 
 
582 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  37.24 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
543 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  36.98 
 
 
496 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.31 
 
 
529 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.93 
 
 
515 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.56 
 
 
482 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.81 
 
 
525 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 
504 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
505 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.11 
 
 
505 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.21 
 
 
509 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.04 
 
 
499 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.95 
 
 
509 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.46 
 
 
490 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.94 
 
 
499 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.69 
 
 
509 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  40.05 
 
 
492 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  39.69 
 
 
498 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  41.33 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.05 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.94 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.3 
 
 
498 aa  211  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.11 
 
 
489 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.18 
 
 
509 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  41.19 
 
 
475 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.99 
 
 
494 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
483 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  80.33 
 
 
405 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  80.33 
 
 
402 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.42 
 
 
478 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.15 
 
 
478 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.15 
 
 
478 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.15 
 
 
478 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.15 
 
 
478 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  39.07 
 
 
484 aa  188  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0905  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  33.51 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.601202  normal  0.184806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  72.27 
 
 
448 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2273  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.54 
 
 
478 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2428  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.54 
 
 
478 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.2 
 
 
483 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1509  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.54 
 
 
478 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3265  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.54 
 
 
478 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0833  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  31.31 
 
 
478 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02068  predicted outer membrane protein  32.88 
 
 
454 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2738  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.84 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.69 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  37.69 
 
 
470 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  69.05 
 
 
405 aa  170  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>