147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0308 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  74.53 
 
 
325 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  74.22 
 
 
325 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  63.55 
 
 
321 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  58.64 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  50.47 
 
 
323 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  48.62 
 
 
321 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  47.35 
 
 
310 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  46.91 
 
 
310 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  37.12 
 
 
313 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  34.41 
 
 
330 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  32.93 
 
 
322 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  35.91 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  35.69 
 
 
310 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.14 
 
 
309 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  35.69 
 
 
311 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.88 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  36.14 
 
 
301 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  35.14 
 
 
309 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.55 
 
 
309 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  33.83 
 
 
322 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  36.88 
 
 
308 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  36.7 
 
 
320 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.53 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  33.73 
 
 
309 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  30.77 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  32.57 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  31.83 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  31.83 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.32 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  30.83 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  28.74 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.23 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  30.45 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.7 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.4 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  31.68 
 
 
305 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.5 
 
 
310 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  27.04 
 
 
312 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  30.04 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  33.16 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  27.69 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.8 
 
 
334 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.95 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  36.88 
 
 
305 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  27.59 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  31.45 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  28.89 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  29.57 
 
 
312 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.45 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  33.51 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  27.52 
 
 
315 aa  89  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  32.16 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  29.57 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  27.58 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  27.69 
 
 
313 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  31.46 
 
 
433 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.7 
 
 
307 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  29.57 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.22 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.33 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.88 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.88 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.24 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  22.4 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.84 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  29.56 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  27.78 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  27.1 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.55 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  24.05 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  23.05 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.82 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  26.1 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  32.04 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  25.14 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  26.92 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.68 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  26.58 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  25.52 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.4 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  21.77 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  27.08 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  25.55 
 
 
456 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  34.36 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  25.79 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  27.01 
 
 
456 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  29.41 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  29.5 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  24.76 
 
 
291 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  31.74 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>