More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0228 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  72.73 
 
 
327 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  70.55 
 
 
318 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  67.19 
 
 
320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  67.19 
 
 
320 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  67.19 
 
 
320 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  70.3 
 
 
324 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  68.67 
 
 
320 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  68.67 
 
 
320 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  64.29 
 
 
325 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  58.84 
 
 
324 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  64.09 
 
 
322 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  64.09 
 
 
322 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  62.42 
 
 
328 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  51.42 
 
 
325 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  50.31 
 
 
356 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  50.84 
 
 
326 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  49.5 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  52.48 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  50.5 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  47.71 
 
 
320 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.97 
 
 
331 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  49.51 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 
329 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  43.61 
 
 
321 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  43.61 
 
 
321 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.18 
 
 
353 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.12 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  42.99 
 
 
321 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  44.85 
 
 
328 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 
326 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.77 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  44.08 
 
 
322 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.61 
 
 
324 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  40.38 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  43.35 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.46 
 
 
332 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.92 
 
 
318 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.46 
 
 
325 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  38.27 
 
 
347 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.57 
 
 
330 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.15 
 
 
330 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.95 
 
 
317 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.63 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.19 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.32 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.98 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.61 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 
358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.37 
 
 
324 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.44 
 
 
330 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.37 
 
 
328 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
331 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 
328 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.54 
 
 
325 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.6 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.67 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.04 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.46 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  44.44 
 
 
337 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  45.2 
 
 
330 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  40.81 
 
 
322 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.44 
 
 
320 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.51 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.32 
 
 
698 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.82 
 
 
339 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.88 
 
 
360 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  40.41 
 
 
337 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  38.26 
 
 
322 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.96 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  40.75 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.34 
 
 
339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.74 
 
 
327 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40.25 
 
 
325 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.82 
 
 
325 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  40.94 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  39.6 
 
 
324 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  37.89 
 
 
322 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 
322 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 
330 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.91 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.71 
 
 
339 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.43 
 
 
356 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.13 
 
 
325 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.55 
 
 
351 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.29 
 
 
323 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.72 
 
 
344 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.26 
 
 
341 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.55 
 
 
318 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.32 
 
 
323 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.62 
 
 
330 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.26 
 
 
355 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.65 
 
 
327 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  39.13 
 
 
323 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 
322 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.68 
 
 
345 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>